長崎市議会9月議会は、9月29日閉会したので、主な補正予算を掲載する。長崎スタジアムシティの施設整備費に対して、補助金を交付していたが、事業者の確定申告により消費税等の仕入控除税額の返還が生じたため、事業者からの返還金の一部を企業版ふるさと納税基金へ積立てる基金積立金1億1,468万3千円。市庁舎本館跡地等における新たな文化施設等の整備を進めるにあたり、事業実施に向けたより具体的な調査を行うため、PPP/PFI導入可能性調査を実施する新文化施設等整備民間活力導入可能性調査費3,500万円。公共施設の使用料見直しに伴い、公共施設案内・予約システムの設定を変更するために必要な経費836万円。旧神浦中学校跡地等の解体や石綿合有分析調査費546万6千円。
県議会議員の辞職に伴い、令和8年度2月予定の県知事選に併せて、県議会議委補欠選挙を執行するために必要な職員給与費・事務費3,014万4千円。新東工場建設事業費におけるインフレスライド条項に基づき、工事費を増額する設建設費4億743万9千円。旧英国領事館及び野口彌太郎記念美術館に係る展示・観光案内施設として令和8年1月30日に開館するため、オープニングセレモニー及び運営に係る運営費1,076万9千円。稲佐山公園の使用料見直しに伴い、展望台駐車場カーゲートの更新を行う経費1,180万円。GIGAスクール構想2期の確実な実現に向け、大規模校で課題となっているネットワーク回線の遅延を改善する教育ICT推進費(小ヶ倉小・小ヶ倉中)2,711万7千円など可決された。