長崎市を中心に新型コロナの感染が大幅に増えているとして、中村県知事は1月6日の記者会見で、県内の感染状況を5段階で示すステージを「４（特定圏域や業種における感染者急増）」に引き上げ、県内全域に特別警戒警報を発令し、不要不急の長崎市内での外出や県外との往来を自粛するよう要請した。要請期間は、1月7日から17日の11日間。特に長崎市は、昨年12月25日から1月5日の間に感染が確認された320人のうち5割超の169人を占め、人口10万人当りで41.5人となり、政府が示した判断指標で「爆発的な感染拡大」にあたる「1週間で25人以上」を上回る水準となっている。止むを得ず外出する際は、人との接触を極力避け、基本的なマスク着用、手洗い・消毒、3密（密閉、密集、密接）の回避などの徹底、慎重な行動を行う必要がある。
